Skladno s 127. členom Uredbe (EU), št. 1303/2013, RO zagotovi, da revizije vključujejo pregled ustreznega poslovanja vodstva in delovanja sistema nadzora programa sodelovanja in so izvedene na ustreznem vzorcu delovanja na podlagi prijavljenih izdatkov. Organ prav tako pripravi tudi poročilo in mnenje o skladnosti vodstva in sistemov nadzora.
Revizijskemu organu pomaga skupina revizorjev (GoA), ki jo sestavljajo predstavniki odgovornih organov iz obeh držav članic, ki sta vključeni v Program sodelovanja. Vlogo revizijskega telesa (revizije na Madžarskem) bo prevzel Generalni direktorat za revizijo evropskih sredstev iz Madžarske.
Predstavniki morajo biti neodvisni od članov Odbora za spremljanje, nadzornikov, določenih na podlagi člena 23 (4) Uredbe o ETS in vseh drugih dejavnosti in finančnih zadev projekta. Skupina revizorjev bo imenovana v treh mesecih od odločitve o potrditvi programa. Skupina bo sestavila svoj poslovnik in jo bo vodil Revizijski organ. Odločitev o telesu, ki bo izvajalo revizije sistema in preverjalo izdatke, bosta sprejela Revizijski organ in skupina revizorjev med postopkom oblikovanja revizijske strategije programa.
Revizijski organ bo svoje naloge izvajal skladno s slovenskimi in z evropskimi institucionalnimi, pravnimi in finančnimi določbami.